Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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BNIP1Q12981 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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BNIP1Q12981 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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BNIP1Q12981 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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