Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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