Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXO1Q12778 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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