Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA2O43364 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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