Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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C9orf135Q5VTT2 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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C9orf135Q5VTT2 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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C9orf135Q5VTT2 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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C9orf135Q5VTT2 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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C9orf135Q5VTT2 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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C9orf135Q5VTT2 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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C9orf135Q5VTT2 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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C9orf135Q5VTT2 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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C9orf135Q5VTT2 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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C9orf135Q5VTT2 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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C9orf135Q5VTT2 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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C9orf135Q5VTT2 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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C9orf135Q5VTT2 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
C9orf135Q5VTT2 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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