Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms