Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HADHQ16836 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HADHQ16836 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HADHQ16836 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HADHQ16836 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HADHQ16836 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
HADHQ16836 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HADHQ16836 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HADHQ16836 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HADHQ16836 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HADHQ16836 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HADHQ16836 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HADHQ16836 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HADHQ16836 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HADHQ16836 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HADHQ16836 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HADHQ16836 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms