Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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LAMA3Q16787 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LAMA3Q16787 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
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