Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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CTF1Q16619 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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CTF1Q16619 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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CTF1Q16619 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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CTF1Q16619 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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