Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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FXNQ16595 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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FXNQ16595 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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FXNQ16595 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FXNQ16595 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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FXNQ16595 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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FXNQ16595 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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FXNQ16595 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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FXNQ16595 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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FXNQ16595 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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