Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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SSX1Q16384 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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SSX1Q16384 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SSX1Q16384 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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