Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPS72Q15906 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.2 ms