Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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VAMP3Q15836 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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VAMP3Q15836 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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VAMP3Q15836 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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VAMP3Q15836 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
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