Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms