Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
TRAM2Q15035 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAM2Q15035 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms