Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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