Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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SHPRHQ149N8 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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SHPRHQ149N8 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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SHPRHQ149N8 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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SHPRHQ149N8 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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