Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PDE1CQ14123 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms