Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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COL9A3Q14050 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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COL9A3Q14050 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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COL9A3Q14050 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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