Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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CNGB1Q14028 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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CNGB1Q14028 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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CNGB1Q14028 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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CNGB1Q14028 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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CNGB1Q14028 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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