Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCINQ13939 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CCINQ13939 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCINQ13939 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCINQ13939 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms