Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms