Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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