Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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