Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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