Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms