Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms