Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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