Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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IFT88Q13099 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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IFT88Q13099 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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IFT88Q13099 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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IFT88Q13099 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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IFT88Q13099 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IFT88Q13099 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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