Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF1Q13077 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms