Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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NFIAQ12857 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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