Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RPS29P62273 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
RPS29P62273 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RPS29P62273 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPS29P62273 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPS29P62273 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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