Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BGRP55822 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms