Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms