Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CRXO43186 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CRXO43186 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms