Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C3Q9Y5Q9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms