Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALKQ9UM73 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms