Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBP3Q9NS15 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
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