Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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