Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ftsj3Q9DBE9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ftsj3Q9DBE9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms