Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGIP1Q9BQI5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms