Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms