Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc73Q8CDM4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms