Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc154Q6RUT8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc154Q6RUT8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms