Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms