Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-1Q15270 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-1Q15270 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms