Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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