Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms