Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sox13Q04891 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms