Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms